| The following thesis are|were developed with HPC infrastructure support SeARCH-ON2. |
| Ongoing thesis |
| Tiago Ferreira, “Tracking molecules of cosmetic interest using molecular simulations”; Programa Doutoral em Engenharia Química e Biológica – CEB; Resources: Gaussian 09, GROMACS; Supervision: Tarsila Gabriel Castro; Duration: 2021/2024. |
| Artem Drogalin, “Swainsonine Analogues Synthesis Assisted by Molecular Modeling. Biological Evaluation”; Applied Chemistry; FCT scholarship; Resources: ADFR, Gaussian 09, GROMACS; Supervision: Tarsila Gabriel Castro; Duration: 2020/2024. |
| Sérgio Veloso; “Development of multifunctional supramolecular magnetogels for multimodal cancer therapy”; Programa Doutoral: Programa Doutoral em Física MAP-Fis, CF-UM-UP; Supervision: Elisabete Coutinho; Duration: 2020/ –. |
| Diogo Telmo Neves, “Separation of Concerns in Advanced Computing”, Programa Doutoral em Informática MAP-i, (Supervision: João Luís Sobral) |
| Concluded thesis |
| André Pereira, “An Efficient Particle Physics Data Analysis Framework for Homogeneous end Heterogeneous Platforms”, Programa Doutoral em Informática MAP-i, (Supervisor: Alberto José Proença) |
| Bruno Silvestre Medeiros, “A framework for heterogeneous many-core machines”, Programa Doutoral em Informática, (Supervisor: João Luís Sobral) |
| João Amaro Oliveira Ferreira, “Optimização do Processo de Recolha de Resíduos: Desenvolvimento de Ferramentas de Investigação Operacional para o Problema de Orientação de Equipas com Multi-Restrições”, Programa Doutoral em Engenharia Industrial e de Sistemas, (Supervisor: José António Oliveira) |
| João Carlos Garcia Barbosa, “Hardware Aware Scheduling in Heterogenous Environments”, Programa Doutoral em Informática MAP-i e na UTexas Austin (dual degree), (Supervisores: Luís Paulo Santos, Alberto José Proença, Donald Fussel) |
| Pedro Miguel Silva Carlos Sousa Ângelo, “Dataflower: Harnessing Heterogeneous Hardware Parallelism for Creative Applications”, Programa Doutoral em Media Digitais, (Supervisor: Luís Paulo Santos) |
| Pedro Tiago Evangelista, “Novel approaches for dynamic modelling of E. coli and their applications in Metabolic Engineering”, Programa doutoral em Bioengenharia, (Supervisores: Isabel Rocha, Bruce Tidor, Miguel Rocha) |
| Rajkumar Ananth, “Design and Optimization of Profile Extrusion Forming Tools”, Programa Doutoral em Líderes para Indústrias Tecnológicas, (Supervisor: João Miguel Nóbrega; co-supervisor: Olga Carneiro) |
| Roberto Ribeiro, “Computational Fluid Dynamics Simulation on Heterogenoeus Computing Systems”, Programa Doutoral em Informática, (Supervisores: Luís Paulo Santos, e João Miguel Nóbrega) |
| Rui António Sabino Castiço da Silva, “Locality optimisation techniques for platform mapping”, Programa Doutoral em Informática, (Supervisor: João Luís Sobral) |
| Sergey Pyrlin, Modeling the physical properties of nanostructures and composites; Programa Doutoral em Física, (Supervisor: Marta Ramos) |
| Tarsila Castro, “Conformational properties of unnatural amino acids in peptidomimetics/foldamers: A molecular modelling study”, Programa Doutoral em Ciência, (Supervisor: Manuel Melle Franco) |
| Waldir Pimenta, “interactive Computer Generated Holography”, Programa Doutoral em Informática MAP-i, (Supervisor: Luís Paulo Santos) |
| Nelson Daniel Ferreira Gonçalves, “Computer Aided Design of Extrusion Dies for Complex Geometry Profiles”, Programa Doutoral em Ciência e Engenharia de Polímeros e Compósitos, 2014, (Supervisores: João Miguel Nóbrega e Olga Machado de Sousa Carneiro) |
| Rui Carlos Araújo Gonçalves, “Parallel Programming by Transformation”, Programa Doutoral em Informática MAP-i ,2015, (Supervisor: João Luís Sobral) |
| Sacha Mould, “Nanocomposites: The contribution of multiscale modeling to improve the dispersion levels in nanocomposite”, Programa Doutoral em Ciência e Engenharia de Polímeros e Compósitos, 2014, (Supervisores: João Miguel Nóbrega e José António Covas) |
| Seyyed Sabet, “Designing the next generation car washing machines, with rotary brushes”, Programa Doutoral em Líderes para Indústrias Tecnológicas, 2015, (Supervisores: João Miguel Nóbrega e Ferrie van Hattum) |